Fundacja Borussia kontynuuje i wspiera działalność, prowadzoną do tej pory przez stowarzyszenie. Ideą przewodnią działań Fundacji jest tworzenie nowych zjawisk kultury ponad podziałami i konfliktami narodowościowymi w jednoczącej się Europie w odwołaniu do wielokulturowego dziedzictwa regionu Warmii i Mazur, dawnych Prus Wschodnich.